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生物芯片 敢问路在何方
源自 2012年03月14日

www.ebiotrade.com 时间:2011年12月13日 来源:生物通


    生物通报道 近几年,由于新一代测序的出现,以及测序实验的成本飞速下降,大家对生物芯片的应用和关注也在不断下降,甚至有预言认为,芯片技术面临消亡。然而,全球著名投资银行William Blair开展了一项关于生物芯片的调查,结果表明此技术在研究领域仍占有一席之地。William Blair的分析员Amanda Murphy表示,尽管生物芯片技术目前主要局限于全基因组关联研究(GWAS),但“考虑到这些平台之间的成本差异,我们相信芯片仍将在研究领域占据一席之地”。她们预计,目前在芯片平台上开展的很多应用最终都将转移至新一代测序平台,然而,新一代测序的成本下降将放缓,因此,从芯片到测序这一转移过程将比投资者们所预测的更加漫长。

    William Blair开展了电子邮件调查,收到了84份反馈信息,随后他们与GWAS以及在遗传分析中使用芯片的领军人物进行了对话。这次调查的初衷是评估Illumina的芯片业务,但调查结果也透露了其竞争对手的情况。
尽管Illumina以测序业务闻名,但它最初是以生物芯片起家的,而芯片业务也占了总收入的35%。Murphy提到,GWAS成为Illumina芯片业务的关键推动者,它占了该公司芯片销售额的四到五成。

    然而到目前为止,GWAS只提供了疾病遗传的有限信息,特别是对于复杂疾病,关于GWAS的价值,以及这些方法在确定疾病遗传元件上的实用性,目前还存在很大争议。因此,芯片公司开始在芯片上整合一些低频率突变内容,试图克服GWAS的缺陷。
与一年前相比,Illumina第三季度的芯片业务下滑了9%,激发了人们对于芯片业务面临淘汰的担心。出现此问题的不仅仅是Illumina一家。Affymetrix过去一直被认为是基因表达芯片的领头羊,这几年日子也不太好过。

    William Blair此次的调查也证实了一些怀疑态度。55%的受访者称,他们不在开展GWAS。而54%的人员表示,他们预计明年的芯片使用将会持平。此外,随着政府的资助缩减,也有人担心芯片研究的资助还可能下降,89%目前使用芯片的受访者称,他们预计2013年的经费将会持平或减少,而70%的人表示,他们实验室暂无计划再买一台芯片仪器。
但是Murphy坚持认为,此技术将会在科研中占据一席之地,并提到一些领军人物对外显子芯片有着特别的兴趣。在10月份召开的美国人类遗传学会年会上,Illumina和Affy都推出了靶定外显子组的芯片。这两家公司认为,这些产品能让研究人员快速经济地验证大量样品中的变异。

    Murphy谈到,她预计芯片将会在应用市场继续使用,如诊断和农业基因组学、欧洲群体之外的大规模GWAS研究,以及定向研究,如外显子组芯片。“我们认为今后两年芯片收入都将稳定,而不是买方预测的下降5%。”(生物通 余亮)